MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_020

Total Repeats: 3430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017105	CATCCA	2	12	67	78	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117720
2	NC_017105	CGGG	2	8	87	94	0 %	0 %	75 %	25 %	384117720
3	NC_017105	GC	3	6	96	101	0 %	0 %	50 %	50 %	384117720
4	NC_017105	ATG	2	6	159	164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117720
5	NC_017105	TGC	2	6	230	235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117720
6	NC_017105	CCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117720
7	NC_017105	GCA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117721
8	NC_017105	GCG	2	6	422	427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117721
9	NC_017105	TCA	2	6	444	449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117721
10	NC_017105	AGG	2	6	526	531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117721
11	NC_017105	TCTG	2	8	561	568	0 %	50 %	25 %	25 %	384117721
12	NC_017105	CTG	2	6	764	769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117722
13	NC_017105	GCT	2	6	841	846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117722
14	NC_017105	CGTC	2	8	874	881	0 %	25 %	25 %	50 %	384117722
15	NC_017105	TGTCC	2	10	886	895	0 %	40 %	20 %	40 %	384117722
16	NC_017105	GAA	2	6	972	977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117722
17	NC_017105	ACAG	2	8	978	985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017105	CCA	2	6	1005	1010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017105	CGC	2	6	1055	1060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017105	AACA	2	8	1292	1299	75 %	0 %	0 %	25 %	384117723
21	NC_017105	CAA	2	6	1336	1341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384117723
22	NC_017105	CAG	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117723
23	NC_017105	GGC	2	6	1474	1479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117723
24	NC_017105	AAC	2	6	1601	1606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384117723
25	NC_017105	CCA	2	6	1749	1754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117724
26	NC_017105	AGG	2	6	1805	1810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117724
27	NC_017105	TCA	2	6	1838	1843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117724
28	NC_017105	T	6	6	1847	1852	0 %	100 %	0 %	0 %	384117724
29	NC_017105	TTG	2	6	1957	1962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384117724
30	NC_017105	A	7	7	2015	2021	100 %	0 %	0 %	0 %	384117724
31	NC_017105	TAG	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017105	AT	3	6	2210	2215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017105	AAG	2	6	2268	2273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017105	CTG	2	6	2343	2348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117725
35	NC_017105	ACG	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117725
36	NC_017105	T	6	6	2388	2393	0 %	100 %	0 %	0 %	384117725
37	NC_017105	GC	3	6	2411	2416	0 %	0 %	50 %	50 %	384117725
38	NC_017105	CGT	2	6	2498	2503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117725
39	NC_017105	TGGC	2	8	2514	2521	0 %	25 %	50 %	25 %	384117725
40	NC_017105	CTA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117725
41	NC_017105	GCC	2	6	2719	2724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117726
42	NC_017105	T	7	7	2776	2782	0 %	100 %	0 %	0 %	384117726
43	NC_017105	CGC	2	6	2790	2795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117726
44	NC_017105	TGT	2	6	2854	2859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384117726
45	NC_017105	AGC	2	6	2875	2880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117726
46	NC_017105	CCA	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117726
47	NC_017105	GCT	2	6	2998	3003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117726
48	NC_017105	CCG	2	6	3009	3014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117726
49	NC_017105	GGC	2	6	3025	3030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117726
50	NC_017105	CCT	2	6	3050	3055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117726
51	NC_017105	CTT	2	6	3113	3118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117726
52	NC_017105	GAA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017105	AAC	2	6	3313	3318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384117727
54	NC_017105	TCGT	2	8	3343	3350	0 %	50 %	25 %	25 %	384117727
55	NC_017105	CGG	2	6	3352	3357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117727
56	NC_017105	TCG	2	6	3373	3378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117727
57	NC_017105	TGT	2	6	3406	3411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384117727
58	NC_017105	ATA	3	9	3528	3536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384117727
59	NC_017105	GAA	2	6	3548	3553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117727
60	NC_017105	CCAT	2	8	3600	3607	25 %	25 %	0 %	50 %	384117727
61	NC_017105	ATAA	2	8	3657	3664	75 %	25 %	0 %	0 %	384117727
62	NC_017105	TCT	2	6	3709	3714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117727
63	NC_017105	GTC	2	6	3878	3883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017105	TTC	2	6	3920	3925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117728
65	NC_017105	TGT	2	6	3938	3943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384117728
66	NC_017105	ATA	3	9	3968	3976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384117728
67	NC_017105	CCAAT	2	10	4003	4012	40 %	20 %	0 %	40 %	384117728
68	NC_017105	TCC	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117728
69	NC_017105	TCA	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117728
70	NC_017105	AGATCA	2	12	4106	4117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384117728
71	NC_017105	A	6	6	4119	4124	100 %	0 %	0 %	0 %	384117728
72	NC_017105	GCA	2	6	4197	4202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117728
73	NC_017105	TGG	2	6	4304	4309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117729
74	NC_017105	GCGGA	2	10	4420	4429	20 %	0 %	60 %	20 %	384117729
75	NC_017105	TCG	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117729
76	NC_017105	TGGG	2	8	4569	4576	0 %	25 %	75 %	0 %	384117729
77	NC_017105	CCTT	2	8	4594	4601	0 %	50 %	0 %	50 %	384117729
78	NC_017105	TGC	2	6	4827	4832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117730
79	NC_017105	CATG	2	8	4908	4915	25 %	25 %	25 %	25 %	384117730
80	NC_017105	GC	3	6	4931	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	384117730
81	NC_017105	CGG	2	6	4959	4964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117730
82	NC_017105	CCA	2	6	5113	5118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117730
83	NC_017105	CCA	2	6	5125	5130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117730
84	NC_017105	CCA	2	6	5140	5145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117730
85	NC_017105	CGG	3	9	5148	5156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117730
86	NC_017105	GGA	2	6	5180	5185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117730
87	NC_017105	CAC	2	6	5204	5209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117730
88	NC_017105	GGC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117730
89	NC_017105	TCC	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117730
90	NC_017105	CCA	2	6	5327	5332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117730
91	NC_017105	TCG	2	6	5391	5396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117730
92	NC_017105	GTG	2	6	5478	5483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117730
93	NC_017105	CCA	2	6	5526	5531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117730
94	NC_017105	GCC	2	6	5567	5572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117730
95	NC_017105	CAG	2	6	5580	5585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117730
96	NC_017105	CAC	2	6	5636	5641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117730
97	NC_017105	GTC	2	6	5741	5746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117730
98	NC_017105	TCA	2	6	5886	5891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117730
99	NC_017105	ATC	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117730
100	NC_017105	TGAGA	2	10	5929	5938	40 %	20 %	40 %	0 %	384117730
101	NC_017105	AGA	2	6	5962	5967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117730
102	NC_017105	GCT	2	6	6000	6005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117730
103	NC_017105	CCG	2	6	6130	6135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117730
104	NC_017105	CTG	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117730
105	NC_017105	GCCTTG	2	12	6177	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117730
106	NC_017105	GCA	2	6	6219	6224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117730
107	NC_017105	GAC	2	6	6241	6246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117730
108	NC_017105	CCG	2	6	6363	6368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017105	AG	3	6	6479	6484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017105	G	8	8	6580	6587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017105	ACAG	2	8	6590	6597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017105	CGG	2	6	6707	6712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017105	TTCC	2	8	6742	6749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017105	GGAA	2	8	6753	6760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017105	GAC	2	6	6873	6878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117731
116	NC_017105	CTT	2	6	6957	6962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117731
117	NC_017105	GT	3	6	6966	6971	0 %	50 %	50 %	0 %	384117731
118	NC_017105	CAG	2	6	7105	7110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117731
119	NC_017105	CGGC	2	8	7116	7123	0 %	0 %	50 %	50 %	384117731
120	NC_017105	GC	3	6	7200	7205	0 %	0 %	50 %	50 %	384117731
121	NC_017105	TCG	2	6	7277	7282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117731
122	NC_017105	GAT	2	6	7287	7292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117731
123	NC_017105	TCG	2	6	7313	7318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117731
124	NC_017105	GGC	2	6	7333	7338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117731
125	NC_017105	GCCT	2	8	7360	7367	0 %	25 %	25 %	50 %	384117731
126	NC_017105	AGC	2	6	7381	7386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117731
127	NC_017105	TCC	2	6	7418	7423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117731
128	NC_017105	GGGC	2	8	7433	7440	0 %	0 %	75 %	25 %	384117731
129	NC_017105	GCG	2	6	7595	7600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117731
130	NC_017105	GCCA	2	8	7656	7663	25 %	0 %	25 %	50 %	384117731
131	NC_017105	GAT	2	6	7696	7701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117731
132	NC_017105	ATG	2	6	7739	7744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117731
133	NC_017105	GCG	2	6	7785	7790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117731
134	NC_017105	CTT	2	6	7863	7868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017105	ACA	2	6	7912	7917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017105	CTG	2	6	7961	7966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017105	G	6	6	7993	7998	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017105	GGC	2	6	8009	8014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017105	ATG	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117732
140	NC_017105	GC	3	6	8169	8174	0 %	0 %	50 %	50 %	384117732
141	NC_017105	GATG	2	8	8287	8294	25 %	25 %	50 %	0 %	384117732
142	NC_017105	GGC	2	6	8326	8331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117732
143	NC_017105	GATGCC	2	12	8361	8372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384117732
144	NC_017105	CGT	2	6	8381	8386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117732
145	NC_017105	TGA	2	6	8438	8443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117732
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147	NC_017105	GGC	2	6	8485	8490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117732
148	NC_017105	GT	3	6	8533	8538	0 %	50 %	50 %	0 %	384117732
149	NC_017105	GTG	2	6	8652	8657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117732
150	NC_017105	GAT	3	9	8684	8692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117732
151	NC_017105	GCA	2	6	8733	8738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117732
152	NC_017105	ACGC	2	8	8768	8775	25 %	0 %	25 %	50 %	384117732
153	NC_017105	GCA	2	6	8877	8882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117732
154	NC_017105	CGT	2	6	8904	8909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117732
155	NC_017105	GGCAC	2	10	8920	8929	20 %	0 %	40 %	40 %	384117732
156	NC_017105	GAA	2	6	8985	8990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117732
157	NC_017105	CCG	2	6	9035	9040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117732
158	NC_017105	GGA	2	6	9133	9138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117732
159	NC_017105	GAA	2	6	9141	9146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384117732
160	NC_017105	TC	3	6	9223	9228	0 %	50 %	0 %	50 %	384117732
161	NC_017105	A	7	7	9291	9297	100 %	0 %	0 %	0 %	384117732
162	NC_017105	TCG	2	6	9354	9359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117732
163	NC_017105	TC	3	6	9387	9392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
164	NC_017105	CGA	2	6	9416	9421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_017105	CTCA	2	8	9447	9454	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
166	NC_017105	GTGC	2	8	9582	9589	0 %	25 %	50 %	25 %	384117733
167	NC_017105	C	6	6	9634	9639	0 %	0 %	0 %	100 %	384117733
168	NC_017105	CTT	2	6	9648	9653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117733
169	NC_017105	CACCC	2	10	9786	9795	20 %	0 %	0 %	80 %	384117733
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172	NC_017105	TGATA	2	10	9944	9953	40 %	40 %	20 %	0 %	384117733
173	NC_017105	CACC	2	8	10017	10024	25 %	0 %	0 %	75 %	384117733
174	NC_017105	GA	3	6	10031	10036	50 %	0 %	50 %	0 %	384117733
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177	NC_017105	TTG	4	12	10144	10155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384117733
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180	NC_017105	GGC	2	6	10599	10604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_017105	TGG	2	6	10650	10655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017105	CTGT	2	8	10675	10682	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_017105	TTC	2	6	10683	10688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117734
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273	NC_017105	AGAT	2	8	15129	15136	50 %	25 %	25 %	0 %	384117737
274	NC_017105	ATC	3	9	15192	15200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117738
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277	NC_017105	ATC	2	6	15308	15313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117738
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399	NC_017105	AAC	2	6	21180	21185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384117742
400	NC_017105	CGC	2	6	21247	21252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117742
401	NC_017105	CTT	2	6	21254	21259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117742
402	NC_017105	T	6	6	21293	21298	0 %	100 %	0 %	0 %	384117742
403	NC_017105	GCA	2	6	21307	21312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117742
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432	NC_017105	GGT	2	6	22671	22676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_017105	GAG	2	6	23129	23134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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